Trong bộ phim, đặc vụ FBI Fox Mulder (David Duchovny) do muốn tìm lại người em gái mất tích của mình, đã dấn thân vào điều tra tại "X-files" với niềm tin rằng em gái của anh đã bị bắt cóc bởi người ngoài Trái Đất. Mulder rất tin tưởng vào sự tồn tại của người ngoài Trái Đất trong khi người tham gia điều tra cùng Fox Mulder là đặc vụ Dana Scully (Gillian Anderson). Ban đầu, Scully không tin vào những điều mà Fox Mulder nói, nhưng với những bằng chứng cụ thể cùng với những vụ án thực tế cô và Mulder trải qua, dần dần Scully đã tin vào những hiện tượng kỳ bí. Tuy nhiên, tới cuối phim thì nhân vật Fox Mulder xuất hiện ít hơn và có thêm sự xuất hiện của một nhân vật chính khác là đặc vụ John Doggett (Robert Patrick). Tới phiên mình, John Doggett lại nghi ngờ tính xác thực của các vụ án trong X-files và lúc này, chính đặc vụ Scully là người đã khiến cho John Doggett dần dần tin vào X-files

Một đội điều tra viên pháp y của Las Vegas được đào tạo để giải quyết các vụ án hình sự bằng cách lùng sục hiện trường vụ án, thu thập bằng chứng không thể chối cãi và tìm ra những mảnh ghép còn thiếu để giải quyết bí ẩn.

Cựu đặc vụ của chính phủ Raymond "Red" Reddington (do James Spader thủ vai) là mục tiêu truy nã hàng đầu của FBI trong cả thập kỷ đột ngột tới FBI tự nguyện đầu thú, đề nghị hỗ trợ bắt tên khủng bố tưởng đã chết từ lâu - Ranko Zamani, với điều kiện chỉ nói chuyện với duy nhất Elizabeth “Liz” Keen - một hồ sơ viên mới của FBI. Chuyện bắt đầu từ đó...

12 Con Khỉ là một bộ phim khoa học viễn tưởng lấy bối cảnh tại tương lai không xa, khi con người chứng kiến thảm họa kinh hoàng nhất, gần như toàn bộ dân số trên trái đất tử vong vì bệnh dịch. Chính quyền đã triệu tập những nhà khoa học ưu tú và lỗi lạc nhất để tìm cách trở lại quá khứ và truy lùng nguồn gốc của căn bệnh lịch sử này nhằm ngăn chặn kịp thời trước khi nó lây lan. Tiến sĩ trẻ James Cole (Aaron Stanford) cùng phái đoàn của mình sau khi trở về quá khứ đã phát hiện ra nhiều bí ẩn kinh hoàng về thảm họa này, nó không chỉ do ngẫu nhiên phát sinh mà là do một tên độc tài đứng ra dàn xếp.