Một ngày nọ, một thiên thạch đen rơi xuống thế giới, và thế giới hoàn toàn thay đổi. Thiên thạch tạo ra những con quái vật kỳ dị gọi là D2, bắt đầu chạy loạn xạ. D2 rất nhanh chóng cấm tất cả âm nhạc, đó là một trong những điều có thể vượt qua chúng. Nhưng có một số người đã chống lại D2. Họ là những phụ nữ trẻ nắm giữ sức mạnh của âm nhạc, "Musicart." Những phụ nữ trẻ này nắm giữ "điểm số" có thể đánh bại những con quái vật. Và cũng có người dẫn dắt những người phụ nữ này, Nhạc trưởng. Anime diễn ra ở Mỹ vào năm 2047, nơi đã sụp đổ nhờ D2. Takt, một nhạc trưởng, đã hợp tác với một Musicart tên là Unmei. Takt mong muốn âm nhạc được quay trở lại thế giới, và Unmei mong muốn phá hủy D2. Mục đích của họ là đi du lịch đến New York

Vào năm 2043, Phiêu Lưu Trong Thế Giới Ảo (Vô Hạn Hệ Thống) – game thực tế ảo online thành công đầu tiên trên thế giới – đã được ra mắt. Bên cạnh khả năng mô phỏng 5 giác quan một cách hoàn hảo, cùng với những tính năng đặc sắc, game hứa hẹn sẽ mang lại cho người chơi một thế giới với những khả năng bất tận. Gần 2 năm sau, cậu học sinh Reiji Mukudori, nay đã sắp thành sinh viên đại học, đã có thể mua game về chơi. Với sự giúp đỡ của anh trai mình là Shu và người bạn Embryo, Reiji bắt đầu chuyến phiêu lưu vào thế giới Infinite Dendrogram. Trong thế giới ảo mà thực đến không ngờ, này, điều gì đang đợi họ ở phía trước?

Học sinh trung học Junta Shiraishi có một mục tiêu đơn giản là sống một tuổi trẻ viên mãn. Trên thực tế, sự vắng mặt của Shiraishi nghiêm trọng đến mức mọi người nghĩ rằng chỗ ngồi của anh ấy trong lớp luôn trống và lầm tưởng rằng anh ấy thường trốn học. Thậm chí còn có một tin đồn kỳ lạ, cho rằng những ai nhìn thấy Shiraishi sẽ được ban phước lành. Người duy nhất nhận ra sự tồn tại của anh ấy là Nagisa Kubo, cô gái ngồi cạnh anh ấy. Tuy nhiên, thật không may cho anh ấy, Kubo thích trêu chọc anh ấy hàng ngày. Khi những trò hề khôi hài của Kubo tiếp tục liên quan đến Shiraishi, anh ấy có thể sớm phát hiện ra rằng tuổi trẻ của mình có thể không nhàm chán như anh ấy nghĩ ban đầu?