Bộ phim dựa trên một câu chuyện có thật trong đó theo bước Danny Bryce (Jason Statham) một đặc vụ không quân đã nghỉ hưu, khi anh buộc phải trở lại để giải cứu người cố vấn và cũng là người đỡ đầu tinh thần của anh trong đội đặc nhiệm. Nhiệm vụ của anh là giết chết ba sát thủ được gửi đi bởi lãnh đạo khôn ngoan của chúng (Clive Owen).

Cư dân thành phố Zion chuẩn bị cho cuộc bảo vệ thành phố khỏi làn sóng tấn công của các cỗ máy. Trong khi đó, Neo bị mắc kẹt ở khoảng giữa "thế giới thực" và ma trận. Còn đặc vụ Smith lại đang có một toan tính có thể tiêu diệt cả hai phe máy móc lẫn con người.

Một giáo sư đơn độc tìm được một cổ vật trong chuyến đi đến Istanbul và giải thoát một ma thần có thể ban cho cô ba điều ước. Đầy đắn đo, cô không thể nghĩ ra là mình muốn ước gì cho đến khi nghe một câu chuyện của ma thần làm cho khao khát được yêu trong cô bùng cháy.

Câu chuyện bắt đầu từ lúc Thế giới sụp đổ, Furiosa phải tự cứu lấy mình để trở về nhà. Một cuộc phiêu lưu hành động độc lập khốc liệt, tiền truyện về quái nữ đồng hành với Max Rockatansky.

6 tháng sau sự kiện ở phần 1, Neo được coi là cứu tinh mới của loài người. Trước nguy cơ bị hàng nghìn cỗ máy săn lùng tấn công vào thành phố Zion, bộ ba Neo, Morpheus, Trinity phải đi tìm lời khuyên từ Nhà tiên tri. Trong khi đó, đặc vụ Smith lại trở nên mạnh hơn bao giờ khi hắn có khả năng nhân số lượng bản thể lên nhiều lần.