12 Con Khỉ là một bộ phim khoa học viễn tưởng lấy bối cảnh tại tương lai không xa, khi con người chứng kiến thảm họa kinh hoàng nhất, gần như toàn bộ dân số trên trái đất tử vong vì bệnh dịch. Chính quyền đã triệu tập những nhà khoa học ưu tú và lỗi lạc nhất để tìm cách trở lại quá khứ và truy lùng nguồn gốc của căn bệnh lịch sử này nhằm ngăn chặn kịp thời trước khi nó lây lan. Tiến sĩ trẻ James Cole (Aaron Stanford) cùng phái đoàn của mình sau khi trở về quá khứ đã phát hiện ra nhiều bí ẩn kinh hoàng về thảm họa này, nó không chỉ do ngẫu nhiên phát sinh mà là do một tên độc tài đứng ra dàn xếp.