Sau khi xem chương trình truyền hình về loài chim và một loài được cho là có hình người được phát hiện ở Châu Phi, Nobita mơ ước có thể được bay bằng đôi cánh. Cậu ta tạo ra đôi cánh bằng gỗ sau khi Doraemon từ chối giúp đỡ cậu ấy , dù nhiều lần thất bại với đôi cánh tự chế của mình. Trong khi giúp Shizuka lấy lại con chim hoàng yến cưng của mình, họ chứng kiến một cánh cổng mở ra trên bầu trời và một con chim hình người cưỡi máy bay lao ra. Anh ta tự giới thiệu mình là Gusuke, một người chim sống ở "Birdopia". Doraemon, Nobita và Shizuka giúp Gusuke sửa chiếc máy bay của mình, và Nobita nhanh chóng trở thành bạn của cậu. Khi Gusuke trở về nhà của mình, Gian và Suneo đã bắt được anh ta và lấy máy bay của anh ta. Ba người còn lại theo họ qua cổng

Trong lần phá án này, nhiệm vụ của Conan là bảo vệ "Viên Đá Định Mệnh" trước lời thách thức của siêu trộm Kid. Trong buổi công diễn vở kịch cuối cùng, hắn hóa thân thành Shinichi và thản nhiên tới gần Ran. Mải tập trung vào mục đích chính, Conan bị mắc bẫy khi bị hắn đánh lạc hướng. Bởi Kid sẽ thực sự hành động trên chuyến bay của cô Juri tới Hakodate... Thảm họa xảy ra trên máy bay khi một hung thủ âm mưu giết cô Juri xuất hiện. Liệu mọi người có sống sót khi cả hai phi công bị nhiễm độc, máy bay đang rơi tự do? Conan có bắt được siêu trộm Kid và giao nộp hắn cho cảnh sát hay không?

Có một mảnh đất huyền bí mà ở đó, loài người và các Pokémon sống hòa thuận, luôn kề vai sát cánh, chiến đấu cùng nhau trong các giải đấu. Và tại thị trấn Masara thuộc vùng Kanto, cậu bé 10 tuổi Satoshi với ước mơ trở thành một người huấn luyện Pokémon, chu du khắp mọi miền và giành được danh hiệu “Chuyên gia Pokémon”. Nhưng mọi chuyện không hề dễ dàng với Satoshi tại buổi chọn lựa Pokémon đầu tiên khi cậu đến muộn và chỉ còn sót lại Pikachu. Cuộc sống của Satoshi cũng từ đó bị đảo lộn hoàn toàn với những tình huống tréo ngoe, những rắc rối dở khóc dở cười do chính sự ngây ngô của Pikachu mang lại. Và cũng từ đó, những hành trình đầy thách thức và thú vị bắt đầu.