Ở vùng núi phía bắc Fiore là Ngôi làng Lửa, nơi lưu giữ một di tích màu xanh lam tươi tốt được gọi là Đá Phượng hoàng. Được giao cho một người phụ nữ bí ẩn tên là Éclair, nó được cho là chứa sức mạnh của một con phượng hoàng cổ đại. Cô ấy lang thang khắp vùng đất một mình và bảo vệ viên đá khỏi bị tổn hại, mặc dù không nhớ tại sao nó lại được cô chăm sóc và chỉ có một hồi ức mờ nhạt nhất về nơi cô phải lấy nó. Sau khi chạm trán với hội phù thủy Fairy Tail, Éclair nhận được lời đề nghị từ Natsu Dragneel và những người bạn của anh để giúp cô khám phá những bí ẩn xung quanh viên đá. Tuy nhiên, giữa cuộc hành trình của cả nhóm, Éclair bất ngờ bị tấn công và viên đá bị lấy đi từ cô. Với điều này, những ý định bất chính nhằm hồi sinh phượng hoàng rực lửa vì sức mạnh vô song của nó được đưa ra ánh sáng, và các pháp sư của Fairy Tail thấy mình trong một tình huống có thể gieo rắc tai họa. Bây giờ họ phải cùng nhau ngăn chặn sự hồi sinh của phượng hoàng và cứu thế giới khỏi đống đổ nát.

Phép thuật, đó không còn là truyền thuyết hay một câu chuyện cổ tích nữa.Nó đã trở thành một công nghệ thực tiễn từ gần một thế kỷ nay. Pháp sư, đó là cách mà người ta gọi những con người mang trong mình một tài năng phép thuật ưu việt. Đối với các quốc gia, sự tồn tại của con người này chính là những vũ khí mạnh mẽ. Nhiều quốc gia trên thế giới đã bị cuốn vào vòng xoáy của cuộc chạy đua trên lĩnh vực đào tạo ma pháp.

Dragon Cry là một tạo tác ma thuật có sức mạnh chết người, được tạo thành một cây trượng bởi sự giận dữ và tuyệt vọng của loài rồng đã tồn tại từ lâu. Giờ đây, sức mạnh này đã bị đánh cắp khỏi tay vương quốc Fiore bởi kẻ phản bội bất chính Zash Caine, kẻ đã cùng nó chạy trốn đến đảo quốc Stella nhỏ bé. Sợ hãi vì quyền lực đã rơi vào tay kẻ xấu, vua xứ Fiore vội vàng cử Fairy Tail đi lấy quyền trượng. Nhưng nhiệm vụ này tỏ ra đáng sợ vì một bí mật bóng tối nằm ở trung tâm của vương quốc Stella. Dragon Cry tiếp nối câu chuyện của họ khi họ tập hợp tất cả sức mạnh của mình để phục hồi các nhân viên bị đánh cắp và cứu cả hai vương quốc.

Có một tin đồn trong thế giới học đường, ấy là về một hiện tượng kì bí gọi là "hội chứng tuổi mới lớn". Một ngày nọ, cậu học sinh cao trung Sakuta Azusagawa đột nhiên thấy một cô gái tai thỏ xinh đẹp xuất hiện trước mặt mình. Cô gái ấy chính là Mai Sakurajima - đàn chị lớp trên của Sakuta và là một nữ diễn viên nổi tiếng hiện đang tạm nghỉ. Không hiểu vì lý do gì mà chỉ có mình Sakuta thấy cái tai thỏ của Mai mà thôi, không ai ngoài cậu có thể thấy được cả. Thế là Sakuta quyết định tìm cách giải mã bí ẩn này. Cậu tiếp cận và dành nhiều thời gian với Mai hơn, và từ đó, cậu dần hiểu ra những cảm xúc bí mật được giấu kín trong Mai. Nào ngờ đâu, những cô gái khác với "hội chứng tuổi mới lớn" cũng bắt đầu xuất hiện trước mặt Sakuta.